《西南大学学报（自然科学版）》是教育部主管，西南大学主办，国内外公开发行的综合性学术期刊。其前身是原《西南农业大学学报（自然科学版）》，创刊于1957年12月，2007年，经新闻出版总署批准，《西南农业大学学报（自然科学版）》更名为《西南大学学报（自然科学版）》。主要刊登农业科学、生命科学、数理科学与化学、地球与环境科学等方面的学术文章。是美国《化学文摘》、《数学评论》，英国《动物学记录》，意大利《农业索引》，中国科学引文数据库、中国学术期刊全文数据库、万方数字资源系统、维普中文科技期刊全文数据库、中国数学文献数据库、《中国数学文摘》、《中国生物学文摘》、《中国无机分析化学文摘》、《中国地理科学文摘》、中国生物医学文献数据库、《俄罗斯文摘》杂志、（联合国）国际农业科技情报系统、国际农业与生物科学研究中心、美国《农业文献题库》、《中国水产文摘》等的来源期刊。